Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubqln3Q8C5U9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubqln3Q8C5U9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms