Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8C5C9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8C5C9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q8C5C9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Q8C5C9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C5C9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C5C9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8C5C9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8C5C9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8C5C9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q8C5C9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms