Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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Cldn17Q8BXA6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn17Q8BXA6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn17Q8BXA6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Cldn17Q8BXA6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Cldn17Q8BXA6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Cldn17Q8BXA6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Cldn17Q8BXA6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn17Q8BXA6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms