Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sall4Q8BX22 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms