Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TtpaQ8BWP5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TtpaQ8BWP5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TtpaQ8BWP5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TtpaQ8BWP5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TtpaQ8BWP5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TtpaQ8BWP5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TtpaQ8BWP5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtpaQ8BWP5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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