Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Pbrm1Q8BSQ9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pbrm1Q8BSQ9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms