Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
5730596B20RikQ8BQ08 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms