Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gga3Q8BMI3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gga3Q8BMI3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gga3Q8BMI3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gga3Q8BMI3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gga3Q8BMI3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gga3Q8BMI3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gga3Q8BMI3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gga3Q8BMI3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gga3Q8BMI3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gga3Q8BMI3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gga3Q8BMI3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gga3Q8BMI3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gga3Q8BMI3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gga3Q8BMI3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gga3Q8BMI3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gga3Q8BMI3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gga3Q8BMI3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gga3Q8BMI3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms