Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc4Q8BKW4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zcchc4Q8BKW4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms