Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tspan12Q8BKT6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tspan12Q8BKT6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms