Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4bQ8BGE6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms