Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htatsf1Q8BGC0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms