Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trmt12Q8BG71 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trmt12Q8BG71 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms