Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc172Q810N9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc172Q810N9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc172Q810N9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc172Q810N9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms