Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cracr2bQ80ZJ8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms