Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Amigo1Q80ZD8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Amigo1Q80ZD8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Amigo1Q80ZD8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Amigo1Q80ZD8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Amigo1Q80ZD8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Amigo1Q80ZD8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Amigo1Q80ZD8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Amigo1Q80ZD8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Amigo1Q80ZD8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Amigo1Q80ZD8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Amigo1Q80ZD8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Amigo1Q80ZD8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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