Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NanogQ80Z64 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NanogQ80Z64 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms