Protein–RNA interactions for Protein: Q80WM4

Hapln4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln4Q80WM4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hapln4Q80WM4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hapln4Q80WM4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hapln4Q80WM4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hapln4Q80WM4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hapln4Q80WM4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hapln4Q80WM4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hapln4Q80WM4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hapln4Q80WM4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hapln4Q80WM4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hapln4Q80WM4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hapln4Q80WM4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hapln4Q80WM4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hapln4Q80WM4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hapln4Q80WM4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hapln4Q80WM4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms