Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup214Q80U93 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup214Q80U93 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms