Protein–RNA interactions for Protein: Q80U22

Rusc2, Iporin, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rusc2Q80U22 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rusc2Q80U22 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rusc2Q80U22 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rusc2Q80U22 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rusc2Q80U22 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rusc2Q80U22 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rusc2Q80U22 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rusc2Q80U22 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rusc2Q80U22 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rusc2Q80U22 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rusc2Q80U22 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rusc2Q80U22 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rusc2Q80U22 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Rusc2Q80U22 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rusc2Q80U22 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rusc2Q80U22 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rusc2Q80U22 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rusc2Q80U22 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rusc2Q80U22 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rusc2Q80U22 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rusc2Q80U22 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rusc2Q80U22 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rusc2Q80U22 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rusc2Q80U22 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rusc2Q80U22 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rusc2Q80U22 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rusc2Q80U22 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rusc2Q80U22 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rusc2Q80U22 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rusc2Q80U22 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rusc2Q80U22 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rusc2Q80U22 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rusc2Q80U22 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms