Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ube2q1Q7TSS2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2q1Q7TSS2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms