Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcdh8Q7TSK3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pcdh8Q7TSK3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms