Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim17Q7TPM3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim17Q7TPM3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms