Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prrc2bQ7TPM1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms