Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN99

Cpeb3, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpeb3Q7TN99 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpeb3Q7TN99 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpeb3Q7TN99 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms