Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smap2Q7TN29 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smap2Q7TN29 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smap2Q7TN29 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms