Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HhipQ7TN16 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HhipQ7TN16 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms