Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Shq1Q7TMX5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Shq1Q7TMX5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Shq1Q7TMX5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms