Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd3eapQ76KJ5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd3eapQ76KJ5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms