Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rph3alQ768S4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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