Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih3Q6ZWS4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms