Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RfflQ6ZQM0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms