Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ncapd3Q6ZQK0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ncapd3Q6ZQK0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms