Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nemp1Q6ZQE4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nemp1Q6ZQE4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms