Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY7

Kdm3b, Lysine-specific demethylase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm3bQ6ZPY7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm3bQ6ZPY7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm3bQ6ZPY7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm3bQ6ZPY7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm3bQ6ZPY7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm3bQ6ZPY7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm3bQ6ZPY7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm3bQ6ZPY7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm3bQ6ZPY7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm3bQ6ZPY7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm3bQ6ZPY7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm3bQ6ZPY7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm3bQ6ZPY7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm3bQ6ZPY7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm3bQ6ZPY7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm3bQ6ZPY7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm3bQ6ZPY7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm3bQ6ZPY7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm3bQ6ZPY7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm3bQ6ZPY7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms