Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

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Length 780 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Glis3Q6XP49 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Glis3Q6XP49 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Glis3Q6XP49 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Glis3Q6XP49 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Glis3Q6XP49 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Glis3Q6XP49 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Glis3Q6XP49 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Glis3Q6XP49 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Glis3Q6XP49 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Glis3Q6XP49 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Glis3Q6XP49 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Glis3Q6XP49 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Glis3Q6XP49 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Glis3Q6XP49 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Glis3Q6XP49 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Glis3Q6XP49 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms