Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc88cQ6VGS5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms