Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ccdc82Q6PG04 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc82Q6PG04 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc82Q6PG04 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc82Q6PG04 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc82Q6PG04 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc82Q6PG04 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms