Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad54bQ6PFE3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54bQ6PFE3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms