Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smchd1Q6P5D8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smchd1Q6P5D8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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