Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atg2aQ6P4T0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg2aQ6P4T0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms