Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ltv1Q6NSQ7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ltv1Q6NSQ7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ltv1Q6NSQ7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ltv1Q6NSQ7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ltv1Q6NSQ7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ltv1Q6NSQ7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ltv1Q6NSQ7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ltv1Q6NSQ7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ltv1Q6NSQ7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ltv1Q6NSQ7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ltv1Q6NSQ7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ltv1Q6NSQ7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ltv1Q6NSQ7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ltv1Q6NSQ7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ltv1Q6NSQ7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ltv1Q6NSQ7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ltv1Q6NSQ7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ltv1Q6NSQ7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ltv1Q6NSQ7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ltv1Q6NSQ7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ltv1Q6NSQ7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ltv1Q6NSQ7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms