Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ParpbpQ6IRT3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms