Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt40Q6IFX3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Krt40Q6IFX3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt40Q6IFX3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt40Q6IFX3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt40Q6IFX3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt40Q6IFX3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt40Q6IFX3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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