Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Otud6aQ6IE21 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otud6aQ6IE21 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms