Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KdsrQ6GV12 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KdsrQ6GV12 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms