Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rftn1Q6A0D4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rftn1Q6A0D4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms