Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thsd7aQ69ZU6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Thsd7aQ69ZU6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms