Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn2Q68FG2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn2Q68FG2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms