Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CilpQ66K08 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CilpQ66K08 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms